實際上，在藏文當中，作意與思惟不是同一個詞，也不是同樣的意思。但是玄奘大師在翻譯的時候，可能是因為作意不好理解，所以在翻譯作意時，時常翻譯成「作意思惟」，或者是「思惟」。但是嚴格說起來，作意是作意，思惟是思惟。說作意與思惟相同，是專指因為翻譯的因素，將作意翻成思惟時，該處的思惟與作意同義的意思。

作意主要有兩種理解：一種是特指「作意心所」，是一種使心警覺而趣所緣之境的心所。但是在止觀章時，則不是特指這種心所，而是一種心識活動，這種心識活動與作意心所的功能相仿，所以假名為作意。妙音笑大師提到，所謂作意，是內心趣入之名，由於「定」能使內心的趣入強而有力，因此對於定，假立作意之名稱。所以這裡的作意，是指使內心強而有力地趣入。

而思惟，狹義地說，也是特指一種心所。俱舍論中：「思謂能令心有造作。」是一種讓心王能夠行動造作的心所。心所與心所之間是相違的，功用不同。所以作意心所與思心所也是相違的。

然而，如果不是以嚴格的法相來界定，而以現代的口語來說的話，二者之間應該有共通之處，不算相違。